| Språk : |
|
| Encyclopedia gemenskap |Encyclopedia Svar |Submit fråga |Ordförråd Kunskap |Överför kunskap |
Proteomics |
    |
|
Proteomik (proteomics) ord från protein (protein) och genomik (genomik) en kombination av två ord, som betyder "en gen grupp uttryckte sitt fulla protein", vilket innefattar en cellulär samt en biologisk Alla uttryckta proteiner. Proteome huvudsak hänvisat till den massa egenskaper nivån av protein, inklusive protein expression nivå, post-translationell modifiering, protein-protein växelverkan, varigenom proteinet nivån av sjukdomarna, Cell Metabolism processer helhetssyn och en övergripande förståelse av begreppet användes första gången av Marc Wilkins i upp 1995.Förord Proteome Research, inte bara för lagen att tillhandahålla den materiella grunden för livet, men också för många typer av sjukdomsmekanismer förtydliga och övervinna ge en teoretisk grund och lösning. Genom normala individer och patologiska individer proteome komparativ analys, kan vi hitta några av de "sjukdomsspecifika proteinmolekyler," som skulle kunna bli nya molekylära mål för läkemedelsutveckling utformning, eller kommer att ge för tidig diagnos av sjukdomar markörer . Sannerligen, de världsomspännande bästsäljande droger själva är målen för proteinet, eller en proteinmolekyl. Därför är proteomicsforskning att utforska livets mysterier inte bara har att arbeta, men också för människors hälsa till enorma fördelar. Proteomik inom biovetenskaplig forskning kring postgenom eran egenskaper. Grundläggande strategi Proteome (Proteome) begrepp har föreslagits av Marc Wilkins, som definieras av en genomet (arvsmassan), eller en cell, vävnad uttryck av alla proteiner (protein). Proteome koncept och begreppet genomet finns det många skillnader, som tillsammans med organisation, eller ens ändra olika miljöförhållanden i transkriptionen av en gen kan vara olika former av mRNA-splitsning, och många former av samma protein kan vara posttranslationsmodifiering. proteinet gruppen inte är en direkt produkt av en genomet, proteomen Antalet proteiner i genomet ibland kan överstiga antalet proteomik (proteomik) i början "utvecklande" staten, experter på området förneka att det är en enkel metod, samma som genomik, inte en sluten, stabil konceptualisering av kunskap, utan snarare ett fält. proteomik fokuserade på dynamisk beskrivning genreglering av genuttryck genom kvantitativ bestämning av protein nivåer, identifiera sjukdomen, läkemedelseffekter på livsprocesserna och förklara mekanismen för reglering av genuttryck som en vetenskap, är proteomicsforskning inte noll, vilket är mer än 20 års historia av proteinet (peptid) spektrum och genen produkten är en förlängning kartteknik. lita på tvådimensionell elektrofores peptidkartläggning (Två-dimensionell gelelektrofores, 2-DE) och vidare bildanalys, medan kartlägga analys genprodukten är beroende av en variation av separation, såsom masspektrometri, aminosyrasammansättningsanalys. Forskningsbas Genomförts sedan början av 1990, Human Genome Project, forskare från olika länder, efter nästan 10 år av ansträngningar, har gjort stora framsteg. Inte bara genomfört mer än tio typer av modellorganismer (från Escherichia coli, Saccharomyces cerevisiae till C. elegans) arvsmassa bestämning av arbete, men också förväntas slutföras under 2003 före alla mänskliga gener i alla sekventiella. Så, vet att alla människans genetiska kod arvsmassa, kan vi godtyckligt styra sjukdom och död för människor gör? I själva verket, inte så enkelt. Genomics (genomik) Även genen aktivitet och sjukdomsrelaterade aspekter att ge mänskligheten med en stark bas, men i själva verket, eftersom de flesta sjukdomar som inte orsakas av genetiska förändringar. Vidare, komplex genuttryck, en och samma gen i olika förhållanden kan olika perioder spela en annan roll. På dessa frågor, kan genomik inte besvaras. Så med Human Genome Project, gjorde den gradvisa fullbordandet av forskarna efter ytterligare genomprojektet är proteomik (proteomet) studie är en av de mycket viktiga element. För närvarande är funktionen av proteinet saknas oerhört. Mest genomet sekvensering av den nyupptäckta gener som kodar för protein funktion är okänd, medan funktionen av proteiner som är kända i termer av deras funktion är främst genom metoder såsom homolog gen funktion härledas analogt. Det förutspåddes att proteinet som kodas av det humana genomet minst hälften av okänd funktion. Därför, under de närmaste åren, med minst 30 typer av biologiska genomet sekvensering slutförandet av arbetet, är ett fokus på forskning bundet till protein fungerar, är ganska Proteome forskning ska fyllas detta mål. I den specifika tillämpningen av proteomik, ger protein viktig roll i sjukdomen proteomik i studiet av mänskliga sjukdomar har en mycket viktig värde. Genome (genomet) innehåller transkription av genetisk information via mRNA, som kallas en cell i ett särskilt fysiologiskt tillstånd eller ett sjukdomstillstånd mRNA-uttryck av alla typer av undergrupper, transkription (transcriptome). Uppenbarligen innehåller olika celler i de olika fysiologiska eller patologiska tillstånd av mRNA-transkriptet gruppen olika typer. generera det translaterade proteinet mRNA, en cell i ett särskilt fysiologiskt tillstånd eller ett sjukdomstillstånd av alla typer av proteiner uttryckta protein som kallas grupp (proteom). På liknande sätt uttryckte olika celler i olika fysiologiska eller patologiska tillstånd proteinspecies är inte samma sak. Proteiner är förövarna av geners funktion, så att proteinet struktur, positionering och protein - protein interaktionsstudier kommer att klargöra vilken typ av fenomen i livet ger en direkt grund. Life science är experimentell vetenskap, så utvecklingen av biovetenskap starkt beroende av utvecklingen av experimentella tekniker. Genom DNA-sekvensanalys teknologi som kärnan teknik för att främja genomforskningsprogam genomicsforskning framsteg, och i gen chip-teknologi som representant för genuttryck teknik för forskare att bidra avsevärt till att förstå mönster genuttryck. I proteome forskning, tvådimensionell elektrofores och masspektrometri kombination av guld och för forskare att förstå mönstret proteinuttryck lysa starkt. Proteomik (proteomics) hänvisar till studier av dessa proteomik teknik och erhållna forskningsresultat. Proteomik studien försöker jämföra celler i olika fysiologiska och patologiska förhållanden skillnader proteinuttryck och likheter i den aktuella klassificeringen och identifieringen av proteiner. Ännu viktigare, till proteomik analysera protein-protein interaktioner och proteiners funktion. Forskning Protein Research 1 proteinidentifiering: Du kan använda endimensionell och tvådimensionell elektrofores gelelektrofores i kombination med västerländska tekniker, med hjälp av protein chips och chips antikropp och co-immunoprecipitation tekniker för identifiering av proteiner. (2) posttranslationsmodifiering: mRNA uttryck av många proteiner som produceras genomgå post-translationella modifieringar såsom fosforylering, glykosylering, plasminogenaktivering. Translationell modifiering av proteiner viktigt sätt justeringsfunktion, så den posttranslationella modifiering av proteinet för att belysa funktionen hos proteinet har en viktig roll. 3 för att bestämma proteiners funktion: analys av enzymaktivitet och för att bestämma om enzymsubstratet, cytokiner bioanalytical / ligand - receptor-bindningsanalys. Du kan använda genknockout och antisensteknologi analys av produkter genuttryck - proteiners funktion. Förutom det uttryckta proteinet efter intracellulära lokaliseringsstudier även i viss mån bidrar till att förstå funktionen av proteiner. Clontech fluorescerande protein expressionssystem är studiet av proteiner i den intracellulära lokaliseringen av ett bra verktyg. 4 För människor proteomicsforskning slutändan att tjäna människors hälsa, i huvudsak avser att främja utvecklingen av den molekylära medicinen. Såsom att hitta molekylen läkemedel mål. Många läkemedel själv är protein, och många droger målmolekylen är protein. Läkemedel kan också störa protein - protein interaktioner. Medicin och sjukdomsmekanismer inom grundforskning, för att förstå människor i olika utvecklingsstadier, växande och olika fysiologiska och patologiska tillstånd och genuttryck i olika celltyper av egenskaper av särskild betydelse. Dessa studier kan hittas direkt med specifika fysiologiska eller patologiska tillstånd besläktade molekyler, och vidare för utformningen av läkemedel som verkar på grundval av en specifik målmolekyl. Celler och även subcellulär forskning Olika utveckling, växande och olika fysiologiska och patologiska tillstånd av olika celltyper genuttryck är inkonsekvent, så proteinexpressionsprodukter studier bör vara korrekt för celler eller subcellulära nivå. Immunohistokemiska tekniker kan användas för att uppnå detta ändamål, men dödlig nackdel med denna metod är den låga flux. LCM (Laser Capture Microdissection) teknologi exakt kan avlägsnas från vävnaden sektioner utredaren celltyp av intresse, är så LCM teknik faktiskt en in situ teknik. Ta bort cellen för protein provberedning, kombinerat med antikroppen chip eller tvådimensionell elektrofores - masspektrometri teknik rutt, kan du göra in situ protein expression av hög genomströmning studier. Många studier med homogeniserad vävnad protein prov färdplan förberedelse teknik, och dess slutsats kan ifrågasättas, eftersom vävnadshomogenat efter olika celltyper av proteiner blandas, kan de resulterande forskningsdata inte förklaras för varje typ av cell protein expression . Även odlade celler kan få en enda celltyp, men svårt att simulera in vitro cell celler in vivo miljö, ingicks så denna studie att kroppen är svårt att förklara den faktiska situationen. Därför bör i studiet av olika celltyper först separeras, separation av olika typer av celler kan användas för genuttrycksstudier, inklusive mRNA och proteinuttryck. LCM-teknik för att erhålla antalet celler kan användas för protein provberedning. Kan framställas i enlighet med det totala proteinet, eller ett membranprotein, eller nukleoprotein, även glykoprotein kan berikas, eller genom att ta bort den typ av protein albumin för att minska komplexiteten. Relaterade kit är tillverkare. 2D SDS Olika typer av protein i provet proteiner kan separeras genom tvådimensionell gelelektrofores. Två-dimensionell gelelektrofores kan vara olika typer av proteiner enligt isoelektrisk punkt och molekylära skillnader vikt i separationen upplösning. Tvådimensionell elektrofores kan vara framgångsrika 2000-3000 sorters protein separation. Efter elektrofores färgades gelén med hög känslighet, såsom silver-färgning och fluorescerande färgning. Om de två proven finns fler likheter mellan protein expression, separat kan framställas på samma villkor i de två proteinproven, på samma villkor och tvådimensionell gelelektrofores, färgning jämför två lim. Proteiner kan också vara två prover märktes med olika fluorescerande färgämnen, och de två proteinerna på provet på en två-dimensionell gelelektrofores separation av de slutliga resultaten av analysen genom fluorescens scanning teknik. Gel färgade gelén bildanalyssystem kan dra nytta av avbildning och analys programvara genom kvantitativ analys av proteiner och proteiner av intresse för att lokalisera. Genom specialiserade proteiner klippsystem, kan du limma proteinfläckar områden där exakta snitt. Då gelén proteinet digererades genom restriktionsenzym digerering efter avsaltning / koncentration processen efter spotting systemet genom spotting proteinet till en specifik yta av materialet (MALDI-TOF). Den sista av dessa proteiner kan analyseras i en masspektrometer för att få kvalitativa data av proteiner; Dessa data kan användas för att bygga upp en databas eller en befintlig databas och jämförande analys. LCM-dimensionell gelelektrofores - masspektrometri teknikfärdplaner är typiskt för en proteomik teknik färdplan, dessutom är LCM-antikropp chip en viktig proteomik teknikfärdplaner. Nämligen av LCM-teknik för att få celltyp av intresse, beredning av cellprover protein med fluorescerande märkta dye proteiner och antikroppar microarray hybridisering, vilket kan jämföra likheter och skillnader mellan de två prover av protein expression. Clontech har nyligen utvecklat en antikropp chip, kan 378 typer av membranproteiner och cytosoliska proteiner analyserades. Chippet i samband med driften av hela viktiga antikroppar chip reagenser, inklusive byggsatser proteinpreparat, proteiner fluorescerande färgämne märkningsreagens, märkt reagens reningssystem, reagenser hybridisering. För studier proteininteraktioner, är jäst två-hybrid och fag display-teknik utan tvekan ett bra forskningsmetoder. Clontech jäst två-hybrid systemet utvecklats och NEB fagdisplay utvecklad för forskarna väljer. På proteome, kan proteinet också vara en del av gruppen eller alla typer av proteiner producerade ett protein chip, kan ett protein chip kan användas för sådana studier proteininteraktioner, och liten molekyl proteinuttryck i proteinbindning. Science, vol. 293, Issue 5537,2101-2105, September 14,2001 publicerade en artikel på chip jäst proteomen papper. Det huvudsakliga innehållet i detta papper: 5800 jästen ORF uttryck i proteiner som produceras och renas spotting chip, då chipet screening kalmodulin och fosfolipid interaktioner molekyl molekyler. Slutligen är det nödvändigt att påpeka att den traditionella enda protein protein forskning fokuserar på forskning, och proteomik fokusera på forskning inom specifika fysiologiska eller patologiska tillstånd av alla proteintyper och med den omgivande miljön (täljare) relation. Därför proteomik forskning är oftast hög genomströmning. Anpassa sig till kraven i proteomik forskning verktyg är oftast högt automatiserade system, hög genomströmning och snabb, med motsvarande analys programvara och databaser, kan forskarna på kortast tid bearbeta data upp till Signifikans och bakgrund Forskning Signifikans Med det mänskliga genomet projektgenomförande och förskott biovetenskaplig forskning har gått in i post-genomiska eran. I denna tid, är det huvudsakliga syftet med studien life science funktionsgenomik, inklusive strukturell genomik och proteomik forskning. Även om det finns ett flertal sekvenserade genom men dessa genom är oftast mer än hälften av geners funktion är okänd. För närvarande genomet antagna strategier, såsom genen chips, genuttryck sekvensanalys (Serial analys av genuttryck, SAGE), är av mRNA från cellerna måste överväga antagandet att nivån av mRNA i celler avspeglar protein expressionsnivåer. Men det är inte helt sant, från DNA mRNA protein, det finns tre nivåer av reglering, nämligen transkriptionsreglering (transkriptionskontroll), translationell reglering (Translational kontroll), post-translationell nivå av reglering (Post-translationell kontroll). Ur mRNA, i själva verket, innehålla endast nivån av transkription reglering, och kan inte helt representativ för nivån av proteinuttryck. Experiment har visat att vävnad mRNA överflöd och protein överflöd korrelation är inte bra, särskilt för låg-överflöd proteiner, är korrelationen ännu värre. Ännu viktigare, posttranslationell modifiering av proteinkomplex, proteinet subcellulära lokalisering eller migration, protein - protein interaktioner, etc. är nästan omöjligt att döma av mRNA-nivån. Självfallet, utförande av fysiologiska funktioner av protein, var fenomenet livet genom den direkta utföringsformen av struktur och funktion av proteinet direkt att belysa fysiologiska eller patologiska tillstånd av liv av den mekanism för ändring. Protein sig i en form och aktivitetsmönster, såsom post-translationell modifiering, protein-protein interaktioner och protein conformational problem, förlitar sig fortfarande på studier av proteiner direkt för att lösa. Även om variationen och mångfalden av proteiner och andra speciella natur ledde till protein forskning tekniken är långt mer komplex än nukleinsyra-tekniker och mycket svårare, men det är dessa egenskaper delta i och påverka hela livet. Traditionella studier av enskilda proteiner sätt har kunnat uppfylla kraven i den post-genomiska eran. Detta beror på att: (a) förekomsten av fenomenet liv är ofta multifaktoriella effekter, med nödvändighet flera proteiner. (2) medverkan av flera proteiner är invävda i nätverket, eller ske parallellt, eller i kaskad orsakssamband. (3) Genomförandet av proteinuttryck av fysiologiska funktioner är mångskiftande, dynamisk, inte så grundläggande som fast genomet. Därför, till komplexiteten av händelser i livet har en omfattande och djupgående kunskap är bunden till hela dynamiken, nätverkets forskning på proteinnivå. Därför, i mitten av 1990-talet, hade det internationella samfundet en ny disciplin - Proteomics (proteomik), som bygger på förekomsten av intracellulära proteiner och aktiviteter av alla slags föremål. Det kan sägas proteomet forskning som utförs inte bara i biovetenskaplig forskning milstolpe i den post-genomiska eran, är postgenom eran en av kärnan i biovetenskaplig forskning. |
| Användare Omdöme | Allt Omdöme [ 1 ]>>> |
| ||||
